2018-12-29 11:34:25
花鱸俗稱鱸魚、七星鱸、花寨，廣泛分布于渤海至南海的近岸水域以及通海的江河水域，是一種廣溫廣鹽性兇猛肉食性經(jīng)濟(jì)魚類，具有生長(zhǎng)較快、適應(yīng)性廣、味道鮮美等特點(diǎn)?；|既是我國(guó)重要海水養(yǎng)殖魚類，也可以作為淡水馴化養(yǎng)殖的重要魚類。2016年我國(guó)花鱸的養(yǎng)殖產(chǎn)量為13萬(wàn)噸左右。但隨著養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展，病害發(fā)生日益嚴(yán)重，細(xì)菌性病害成為限制其養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的重要因子。破譯花鱸基因組、發(fā)掘抗病抗逆生長(zhǎng)等重要性狀相關(guān)功能基因成為擺在水產(chǎn)科技工作者面前的重要課題。
在青島海洋科學(xué)與技術(shù)試點(diǎn)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室科技創(chuàng)新計(jì)劃和鰲山人才培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目的支持下，中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所陳松林研究員領(lǐng)銜并聯(lián)合青島華大基因研究院歷經(jīng)3年努力，首次完成了花鱸全基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜繪制，研究論文“Chromosome-level genome assembly of the spotted sea bass, Lateolabrax maculatus”最近在國(guó)際重要刊物GigaScience雜志發(fā)表（https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giy114/5099471?guestAccessKey=3685f70d-474e-4a70-a654-642bc2e0815b）。該研究通過新一代測(cè)序和HI-C三維基因組技術(shù)，構(gòu)建了染色體水平的花鱸基因組圖譜。揭示花鱸基因組大小為668Mb，重復(fù)序列為132Mb，注釋基因?yàn)?2015個(gè)。進(jìn)化分析表明花鱸與歐洲鱸魚關(guān)系最近，大概在87Mya開始分化，并且兩者染色體之間呈現(xiàn)較好的共線性。此外，通過比較基因組學(xué)分析，篩選到125個(gè)花鱸特異基因家族，可能與花鱸自身的特征密切相關(guān)。花鱸全基因組的解譯對(duì)于花鱸生命特征的深入認(rèn)知以及花鱸分子遺傳育種的研究具有重要意義，為建立花鱸基因組選擇育種技術(shù)、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術(shù)手段。
黃海水產(chǎn)研究所邵長(zhǎng)偉、青島華大基因研究院李暢為該論文的共同第一作者，陳松林研究員和青島華大基因研究院的劉心博士為該論文的通訊作者。
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