2020-03-05 10:25:47
本報(bào)訊（李瑩 記者 操戈 鄧衛(wèi)哲）近日，由中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所國(guó)家中藥材產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系?？诰C合試驗(yàn)站和中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所崔鵬團(tuán)隊(duì)合作發(fā)布了白木香基因組精細(xì)圖譜，相關(guān)研究結(jié)果已發(fā)表。
基因組精細(xì)圖譜的發(fā)布將為野生白木香種群保護(hù)生物學(xué)、沉香結(jié)香機(jī)制和香味基因及樹(shù)種的進(jìn)化研究奠定良好基礎(chǔ)，也為進(jìn)一步基于基因組的白木香分子育種工作提供了可能，在基礎(chǔ)研究及應(yīng)用領(lǐng)域均具有重要意義。
這項(xiàng)研究利用OxfordNanopore和Il?lumina測(cè)序，結(jié)合Hi-C數(shù)據(jù)生成了220.61Gb的高質(zhì)量讀長(zhǎng)。組裝后的白木香基因組大小約為726.5Mb，其中716.6Mb的序列被錨定至8條染色體上，ScaffoldN50為88.78Mb，BUSCO分析結(jié)果為95.2%。重復(fù)序列占基因組的比例為59.13%，共注釋了29203個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。根據(jù)單拷貝基因的系統(tǒng)發(fā)育和分化時(shí)間估算，發(fā)現(xiàn)白木香與其在錦葵目的最近共同祖先大約在53.18-84.37百萬(wàn)年前分開(kāi)。
據(jù)介紹，白木香是瑞香科中第一個(gè)基因組組裝至染色體水平的物種，隨著后期更多個(gè)性化數(shù)據(jù)的裝配和分析，新版基因組圖譜將持續(xù)保持更新。
白木香是傳統(tǒng)名貴藥材和天然香料“沉香”的重要基源植物，主要分布于中國(guó)南部的熱帶及亞熱帶地區(qū)。在自然條件下，僅有7%-10%的白木香可以結(jié)香，且形成過(guò)程極為緩慢，通常需要數(shù)十年。良好的醫(yī)藥價(jià)值和巨大的經(jīng)濟(jì)效益，導(dǎo)致了對(duì)白木香的掠奪式采伐，其野生資源已日漸枯竭。野生白木香是國(guó)家II級(jí)保護(hù)植物、被《中國(guó)生物多樣性紅色名錄（高等植物卷）》和IUCNRedlist列為易危物種，收錄在CITES附錄二中。
海南省政府對(duì)沉香產(chǎn)業(yè)高度重視，為全面推動(dòng)海南沉香產(chǎn)業(yè)發(fā)展，近年來(lái)相繼印發(fā)《海南省沉香產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃（2018-2025年）》和《海南省推進(jìn)沉香產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展工作方案》，就規(guī)范沉香科學(xué)種植、提升科技創(chuàng)新能力、推動(dòng)產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展、完善市場(chǎng)建設(shè)等方面提出明確任務(wù)，提出要逐步把海南省建設(shè)成為世界優(yōu)質(zhì)沉香原料基地、全國(guó)最大的精深加工生產(chǎn)基地和貿(mào)易中心。
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