2023-02-22 14:53:34
日前,由安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)豬遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊聯(lián)合博瑞迪生物技術(shù)有限公司研發(fā)的兩款50K液相基因芯片正式公開應(yīng)用,兩款芯片命名為“皖芯1號”和“皖芯2號”,分別應(yīng)用于區(qū)域內(nèi)地方豬品種和瘦肉型商業(yè)豬品種的遺傳分析、品種和血統(tǒng)鑒定、基因檢測與分析、基因組育種值估計及基因組選擇育種等。
兩款基因芯片均采用GenoBaitsR技術(shù)模塊靈活組合的設(shè)計思路,在豬通用40K液相基因芯片模塊的基礎(chǔ)上添加了課題組團(tuán)隊多年來鑒定的重要經(jīng)濟(jì)性狀的功能基因和QTL位點(diǎn)(共計10K),創(chuàng)制了適用于區(qū)域內(nèi)的更高效、更精準(zhǔn)、更靈活、低成本專制基因芯片,實現(xiàn)海量基因型分析。經(jīng)過測試,兩款芯片的SNP位點(diǎn)在染色體上分布均勻且位點(diǎn)密度適中,芯片位點(diǎn)分型準(zhǔn)確性和檢出率均在99%以上,基因檢測性價比較高。
“皖芯1號”芯片
“皖芯2號”芯片
“皖芯1號”基因芯片整合了我省7個地方豬品種基因組變異位點(diǎn),涉及的功能位點(diǎn)包括生長、體型、繁殖、肉質(zhì)、抗性等經(jīng)濟(jì)性狀??捎糜趨^(qū)域內(nèi)地方豬的基因精準(zhǔn)鑒定及重要性狀基因的挖掘利用,開展基因組高效選擇,培育各具特色的地方豬新品系和配套系組合。
“皖芯2號”基因芯片整合了長白豬、大白豬、杜洛克豬3個品種基因組變異位點(diǎn),重點(diǎn)補(bǔ)充了肉質(zhì)、繁殖、抗性和利用年限等功能位點(diǎn)信息??捎糜趨^(qū)域內(nèi)瘦肉型種豬全基因組關(guān)聯(lián)分析和基因組選擇育種工作。
兩款基因芯片的成功創(chuàng)制,可加速實現(xiàn)安徽種豬從傳統(tǒng)的常規(guī)育種模式向高效、定向、精準(zhǔn)的分子設(shè)計育種模式轉(zhuǎn)變,大大加快安徽省種豬的育種進(jìn)展,助力畜禽種業(yè)的提升。新技術(shù)的推廣應(yīng)用,對加快培育安徽省自主知識產(chǎn)權(quán)的“皖系種豬”也將具有巨大的推動作用。
全媒體記者 郭媛媛 通訊員 鄭先瑞