2023-03-28 09:02:33
近日,記者在寧夏召開(kāi)的“枸杞功能基因組學(xué)研究與應(yīng)用”項(xiàng)目工作推進(jìn)會(huì)上獲悉,針對(duì)枸杞高度雜合、基因組復(fù)雜等特點(diǎn),該項(xiàng)目已獲取大量枸杞序列資源,開(kāi)發(fā)出專門的分析流程,組裝出枸杞參考基因組,鑒定了大量結(jié)構(gòu)變異,構(gòu)建了枸杞的變異組圖譜。目前,項(xiàng)目組正在開(kāi)展枸杞圖形化泛基因組圖譜構(gòu)建工作。
據(jù)悉,“枸杞功能基因組學(xué)研究與應(yīng)用”項(xiàng)目是寧夏科技廳2022年7月正式啟動(dòng)實(shí)施的首批4個(gè)“揭榜掛帥”科技項(xiàng)目中的一項(xiàng),旨在解決寧夏枸杞產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展中的“卡脖子”技術(shù)。該項(xiàng)目由國(guó)家枸杞工程技術(shù)研究中心牽頭,寧夏農(nóng)林科學(xué)院枸杞科學(xué)研究所所長(zhǎng)曹有龍課題組聯(lián)合西北農(nóng)林科技大學(xué)、四川大學(xué)、北京林業(yè)大學(xué)等單位共同實(shí)施。項(xiàng)目將針對(duì)枸杞參考基因組遺傳信息偏少、功能基因研究滯后、品種選育周期長(zhǎng)等問(wèn)題,選取10份代表枸杞材料,構(gòu)建泛基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。
圍繞枸杞產(chǎn)業(yè)發(fā)展和智能設(shè)計(jì)育種的重大戰(zhàn)略需求,項(xiàng)目組聚焦枸杞基因組信息偏少、重大有育種價(jià)值基因發(fā)掘不足、品種選育周期長(zhǎng)等瓶頸問(wèn)題,在前期枸杞種質(zhì)精準(zhǔn)鑒定和遺傳多樣性分析基礎(chǔ)上,選取了14份代表枸杞種質(zhì)材料,利用最新測(cè)序技術(shù)進(jìn)行高通量測(cè)序,獲得了超過(guò)5Tb的數(shù)據(jù),獲得了大量枸杞序列資源,構(gòu)建了枸杞的變異組圖譜。
在此基礎(chǔ)上,項(xiàng)目組已初步建立起枸杞的高效遺傳轉(zhuǎn)化體系,轉(zhuǎn)化效率達(dá)到50%。同時(shí),項(xiàng)目組首次將基因編輯技術(shù)應(yīng)用到枸杞種質(zhì)創(chuàng)制中,對(duì)枸杞的3個(gè)棘刺基因進(jìn)行了編輯,單靶點(diǎn)編輯效率達(dá)60%,雙靶點(diǎn)編輯效率17%,成功獲得基因編輯植株。該技術(shù)將加速枸杞品種的遺傳改良,加快枸杞的分子育種進(jìn)程。
“下一步,我們將對(duì)枸杞重大功能基因的挖掘應(yīng)用開(kāi)展研究,支撐我們枸杞產(chǎn)業(yè)在資源和種質(zhì)創(chuàng)新方面有大突破,同時(shí)定向培育更多藥用、大果型枸杞新品種,滿足枸杞產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求,支撐枸杞產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。”項(xiàng)目組相關(guān)負(fù)責(zé)人表示。