2024-05-20 08:58:17
近日,筆者從云南省科技廳了解到,云南省畜牧獸醫(yī)科學院羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)研發(fā)與應用創(chuàng)新團隊成功研發(fā)云上黑山羊基因身份證和云上黑山羊50K育種芯片。
云上黑山羊基因身份證和50K育種芯片作為云南省畜牧獸醫(yī)科學院自主研發(fā)、具有自主知識產(chǎn)權(quán)的檢測手段,不但可以開展國家級主導品種——云上黑山羊的精準鑒定,而且能夠提高云上黑山羊精準育種水平和育種效率,為規(guī)范云上黑山羊種羊推廣、提高云上黑山羊種質(zhì)價值提供了技術(shù)支撐。
云南省畜牧獸醫(yī)科學院研究團隊對我國南方主要的4個黑山羊品種(類群)160只個體進行深度基因組測序獲取各品種特異性位點后,利用Mass Array分子檢測平臺對3072個樣本進行分型檢測,借助機器學習方法建立了云上黑山羊鑒定模型并完成模型的優(yōu)化,挖掘出能夠作為純種云上黑山羊基因標識鑒定的26個SNP位點,最終研發(fā)出云上黑山羊基因身份證,目前該基因身份證鑒定成功率達90%,是國內(nèi)唯一開展云上黑山羊品種鑒定的試劑盒。
云上黑山羊50K育種芯片,基于山羊通用芯片功能位點,融合了74個云上黑山羊繁殖性狀、生長性狀和基因身份證的功能位點共計5萬個SNP位點,平均檢出率可達98.77%,分型一致性可達99.3%,比通用芯片檢測成本降低30.91%。該芯片不但可用于云上黑山羊全基因組選擇育種、重要經(jīng)濟性狀功能基因挖掘,還可用于云南本地山羊種質(zhì)資源創(chuàng)新利用與保護、親緣關(guān)系鑒定等,是目前國內(nèi)唯一一款云上黑山羊育種芯片,相較通用芯片,在降低分子育種成本、提高選種準確率方面優(yōu)勢明顯。